6月3日公布的《长江三角洲城市群发展规划》提出，探索建立自由贸易港区。依托舟山港综合保税区和舟山江海联运服务中心建设，探索建立舟山自由贸易港区，率先建立与国际自由贸易港区接轨的通行制度。

就在一个多月前，国务院批复原则同意设立舟山江海联运服务中心。舟山江海联运服务中心范围包括舟山群岛新区全域和宁波市北仑、镇海、江东、江北等区域，陆域面积约2500平方公里，海域面积约2.1万平方公里。

批复要求以宁波一舟山港为依托，加快发展江海联运，完善铁路内河等集疏运体系，增强现代航运物流服务功能，提升大宗商品储备加工交易能力，打造国际一流的江海联运综合枢纽港、航运服务基地和国家大宗商品储运加工交易基地，创建我国港口一体化改革发展示范区。

早在2013年国务院批复《浙江舟山群岛新区发展规划》时就提出“全方位提高对外开放水平和层次，加快建设舟山港综合保税区，条件成熟时探索建立自由贸易园区和自由港区，将舟山群岛新区建设成为我国重要的海上开放门户。”

今年初公布的浙江省2016年《政府工作报告》中提出，加快规划建设舟山自由贸易港区；浙江省“十三五”规划也明确指出，“十三五”期间，浙江将顺应国际经贸投资规则的新变化，全方位提升宁波舟山口岸开发开放水平，争取设立自由贸易港区，充分发挥省海港集团大平台作用，统筹建设大宗商品储备加工交易基地，加快建设舟山江海联运服务中心和绿色石化基地。

舟山市2016年《政府工作报告》明确，规划建设以油品储备、加工及投资贸易自由化为特色的自由贸易试验区。加强与国家有关部委的沟通对接，全力争取舟山进入全国第三批自由贸易试验区行列。以舟山港综合保税区为载体，开展自由贸易政策的探索实践。

据21世纪经济报道了解，此前争议较大的是，由于和上海靠近，舟山自由贸易港区如何找准自己的定位，与上海自贸区错位发展。

舟山自由贸易港区的优势主要在于：一是监管方便、二是辐射较广、三是地理位置特殊试验风险较低。上海自贸区注重服务贸易、金融、高科技，而舟山自由贸易港区是海岛型经济，注重港口物流。

从2010年起，宁波—舟山港的货物吞吐量开始超过上海港，2015年货物吞吐量全球最大。